גם גנים יכולים להיות תלותיים

לאחר התמודדות מאתגרת מול מאות קבוצות מאוניברסיטאות מובילות בעולם, זכתה נבחרת אוניברסיטת תל אביב בפרס התוכנה הטובה ביותר בתחרות עולמית בתחום הביולוגיה הסינתטית.

אייג'ם (IGEM) זו תחרות עולמית בתחום הביולוגיה הסינתטית או במילים אחרות הנדסה תוך תאית. מתחרות בה מאות קבוצות מרחבי העולם כולל האוניברסיטאות המובילות בעולם. כל צוות הוגה רעיון ומממש אותו בדומה להקמת חברת הזנק. 

הנבחרת שלנו

הנבחרת כוללת 12 סטודנטים תחת הנחייתו של פרופ' תמיר טולר הלומדים בפקולטות שונות באוניברסיטה (הנדסה, ביולוגיה, רפואה ומדעים מדויקים) מתוכם 5 סטודנטים מהפקולטה להנדסה. 

• קרין סיונוב, תואר ראשון בהנדסה ביו-רפואית (סיימה שנה ד') - קפטנית הנבחרת
• ניב עמיתי, סטודנט לתואר שני בהנדסת חשמל (שנה שניה).
• הדר בן שושן, סטודנטית במסלול הישיר לתואר שני בהנדסה ביו-רפואית (שנה ד')  
• נועה קרייצר, סטודנטית במסלול הישיר לתואר שני בהנדסה ביו-רפואית (שנה ד')  
• בר גליקשטיין, סטודנטית במסלול הישיר לתואר שני בהנדסה ביו-רפואית (שנה ד')
• איתמר מנוחין, סטודנט לתואר שני במתמטיקה שימושית, שנה ראשונה. 
• מתן ארבל, סטודנט לתואר שני בגנטיקה
• דורון נאקי, סטודנט במסלול הישיר לדוקטורט במיקרוביולוגיה (שנה רביעית).
• עומר אדגר, סטודנט לרפואה (שנה שלישית).
• איתי קציר, סטודנט לתואר שני בביולוגיה מולקולרית (שנה ראשונה). 
• דויד קניגסברגר, סטודנט לתואר שני בביולוגיה (שנה ראשונה). 
• עינב סעדיה, סטודנטית לתואר ראשון בביולוגיה (שנה ג').

בתמונה מימין לשמאל: נועה קרייצר, בר גליקשטיין, ניב עמיתי, קרין סיונוב (קפטנית הנבחרת), ובן שושן

מציאת היציבות בהעברת גנים מיצור ליצור

ההנדסה הגנטית מבוססת על היכולת להכניס גנים מיצור אחד ליצור אחר. האתגר בתהליך הזה הוא חוסר היציבות של גנים כאלה, שבדרך כלל "נמחקים" די מהר. מטרת צוות IGEM שלנו השנה הייתה למצוא פתרון לבעיה האקוטית הזו. בגדול הרעיון היה לקשור את הגן החדש שאנחנו רוצים להוסיף לאורגניזם כלשהו (המאכסן) לגן אחר שחיוני לשרידות של האורגניזם, כך שבעצם האורגניזם הופך להיות "מכור" ותלוי בגן שהוספנו ולא יכול "להיפטר" ממנו.

מבעיה לפתרון מהפכני

הצוות פיתח פתרון שכלל בין השאר:

• פיתוח שיטה ניסיונית חדשה לבחירה של הגן החיוני שאליו כדאי לקשור את הגן החדש.
• אלגוריתמים לתכנון של שני הגנים האלה כך שהם "יעבדו" במאכסן בצורה יעילה.
• תוכנה ידידותית שמאפשר תכנון ואיפטום (שיפור וייעול תהליכים וביצועים) של שני הגנים האלה.

פרופ' טולר והנבחרת השיגו בקשת פטנט על השיטה וגם חברת התרופות לונזה השוויצרית, שאחד ממרכזי המו"פ שלה נמצא בחיפה, מעוניינת לתמוך בפרויקט וכבר תרמה תקציב.  

חבר השופטים וקריטריונים לזכייה

חבר השופטים מורכב בדרך כלל ממדענים, פרופסורים וחוקרים עם הרבה ניסיון בתחום. חלק גדול השתתף בעבר בתחרות או שהוא מנחה של קבוצה בתחרות. רשימת הקריטריונים לזכייה בתחרות מתועד באתר של התחרות https://2020.igem.org/Main_Page.

השופטים יחליטו על הזוכים על סמך הקריטריונים הבאים:

• אתר: תיעוד כל קבוצה באתר שלה. לכל קבוצה קיים אתר המכיל את כל פרטי הפרויקט שלו.
• סרטון המסביר על הפרויקט.
• פוסטר
• ראיון: שופטים מהתחרות יראיינו את הנבחרת וישאלו אותם שאלות במשך לפחות 20 דקות. גם הקהל יוכל להצטרף ולשאול שאלות.