EE Seminar: Kidney Segmentation and Renal Lesion Detection in 3D CT

06 בדצמבר 2017, 15:00 
חדר 011, בניין כיתות-חשמל  

Speaker: Neta Gertzovsky

M.Sc. student under the supervision of Prof. Nahum Kiryati and Dr. Arnaldo Mayer

 

Wednesday, December 6th 2017 at 15:00

Room 011, Kitot Bldg., Faculty of Engineering

 

Kidney Segmentation and Renal Lesion Detection in 3D CT

 

Abstract

 

Renal cysts are common in aging kidneys, and are usually found incidentally in patients undergoing abdominal imaging for other reasons. Although most cysts are benign, they require expert examination as some of them may either indicate the presence of a malignancy or evolve into one. So far, the proposed algorithms for the analysis and detection of renal cysts have been either semi-automatic or evaluated on fairly small data-sets. Here we present a fully automatic method to segment kidneys and to detect simple renal cysts. A fully convolutional neural network (FCN) is employed for segmentation of the kidneys. A combined 3D distance map of the kidneys and surrounding fluids provides initial candidates for cysts. Then, a convolutional neural network (CNN) classifies the candidates as cysts or non-cyst objects. Performance was evaluated on 52 randomly selected volumetric CT scans with 70 cysts annotated by an experienced radiologist, with promising results.

Another type of renal lesions are cancerous renal tumors. Though also usually an incidental finding, they are malignant and often fatal. Early detection of such tumors is highly advantageous for recovery. Using the same methods and similar data we attempted to develop a fully automatic system for detection of cancerous renal tumors. We present our experiments and preliminary results and discuss the steps we deem required to undertake this challenge.

ברוכים הבאים לאתר ארגון בוגרי הנדסה

הארגון פועל במטרה ליצור רשת חברתית של בוגרי הפקולטה, אשר מסייעת לחבריה בידע, בניסיון מצטבר, בקשרים לאנשים ולארגונים, בטיפוח קשרים חברתיים, ומפתחת שיתופי פעולה עם הפקולטה. הארגון פועל ליצירת בסיס לפעילויות משותפות תעשייה-אקדמיה, לעדכן את הבוגרים באופן שוטף בפעילויות הפקולטה, ליזום כנסים ואירועים לבוגרים, לארגן מפגשים חברתיים, לשתף את הבוגרים בפעילות חברתית ובתרומה לקהילה וליצור הזדמנויות לפיתוח קשרים.

 TAU-SERI
TAU-SERI המיזם למחקר להנדסת מערכות
עודכן: 12.02.2019

קול קורא למועמדים לחברי סגל 

קול קורא למועמדים לסגל בכיר במסלול קביעות בביה"ס להנדסת חשמל באוניברסיטת ת"א

קישור לתאור המשרה

מועמדים להנדסת חשמל – מערכות מתבקשים לפנות לפרופ' שי אבידן (avidan@eng.tau.ac.il)

מועמדים להנדסת חשמל – אלקטרוניקה פיזיקאלית מתבקשים לפנות לפרופ' קובי שויער (kobys@eng.tau.ac.il)

 

משרות לסטודנטים בקבוצות מחקר  

לקבוצת מחקר בהנדסת חשמל במחלקה לאלקטרוניקה פיזיקלית בפקולטה להנדסה דרוש סטודנט מצטיין לתואר שלישי לפרויקט חדשני בתחום חיישנים מבוססי טרנזיסטורים

בוגרי תואר שני בהנדסת חשמל/פיזיקה/חומרים/כימיה/מוזמנים לפנות אל פרופ' יוסי רוזנוקס או ד"ר יוסי חיון

 

 

לקבוצת מחקר בהנדסת חשמל במחלקה לאלקטרוניקה פיזיקלית בפקולטה להנדסה דרוש סטודנטים מצטיינים לתואר שני/שלישי לפרויקטים חדשניים בתחום הננו-פוטוניקה:

 

אינטראקציה בין אור לחומר בממדים ננומטרים – מקורות אור חדשים ומניפולציה של חלקיקים אלמנטריים.  פרטים נוספים ניתן למצוא בעמוד הבא:  http://tam-son3.eng.tau.ac.il/~kobys/wp/wp-content/uploads/2017/06/accelerator.jpg

 

התקנים פאסיביים ואקטיביים לאופטיקה משולבת המבוססים על חומרים פולימריים.  פרטים נוספים ניתן למצוא בעמוד הבא:  http://tam-son3.eng.tau.ac.il/~kobys/wp/wp-content/uploads/2017/06/3D_polymer_optics.jpg

 

פיתוח טכנולוגיות למימוש מטא-משטחים ומטא-חומרים אקטיביים.  פרטים נוספים ניתן למצוא בעמוד הבא:  http://tam-son3.eng.tau.ac.il/~kobys/wp/wp-content/uploads/2017/06/nanoantenna.jpg

בוגרי תואר ראשון ושני בהנדסת חשמל/פיזיקה מוזמנים לפנות לפרופ' קובי שויער: kobys@eng.tau.ac.il

 

 

למחקר בתחומים של תורת המערכות, בקרה וביולוגיה מערכתית דרושים סטודנטים מצטיינים לתואר שני ושלישי. אפשרות למלגה מוגדלת

לפרטים נוספים אנא פנו באימייל לפרופ' שי אבידן (avidan@eng.tau.ac.il)

 

 

 

לשלב עבודה מאתגרת בטושיבה עם מגורים ביפן

26 נובמבר 2017
הזדמנות פז לסטודנטים מהפקולטה להנדסה

בתאריך ה 20.11.17 חברת KLA-Tencor, החברה מזה 4 שנים בארגון עמיתי התעשיה של הפקולטה להנדסה, הביאה נציגים מחברת TOSHIBA לביקור מרתק בקמפוס.

 

מטרת הביקור

מנהל הייצור של חטיבת הזכרונות של חברת TOSHIBA יפן, יחד עם משלחת נציגות משגרירות יפן בישראל, הגיעו לביקור בפקולטה להנדסה. בין היתר הם הגיעו בכדי לפגוש את הסטודנטים של הפקולטה, לשמוע מהם על לימודיהם, ולא פחות חשוב - להציג בפניהם אפשרות למשרה חלומית לרילוקיישן ביפן. מי שיתקבל יצטרף לצוות החדשנות הטכנולוגית שלהם.

 

קצת על האורחים

KLA-Tencor היא מהחברות המובילות בעולם בתחום פתרונות למדידה ובקרה של ייצור שבבים. בתחום הזכרונות טושיבה הינה הספק הגדול ביותר השולט על למעלה משליש שוק הזכרונות העולמי, שוק של עשרות רבות של מיליארדי דולר. בין האורחים איתם נפגשנו היו מר אורי תדמור – נשיאה החדש של  KLA-Tencor Israel; גב' ויקי פלטניק – מנהלת משאבי אנוש; גב' אלה קוגן האחראית על גיוס וקשרי אקדמיה; מר טאקשי פוקאמי  (Fukami Takeshi) – נשיא חברת KLA יפן;  קויצ'ירו שיבאמה (Koichiro Shibayama) – מנכ"ל קבוצת Yokkaichi Operation בטושיבה; טושינובו נינו (Toshinobu Niino) - מנהל משאבי אנוש של קבוצת  Yokkaichi Operation  בטושיבה. בנוסף, נכחו בביקור נציגות שגרירות יפן בישראל: גב' ריי מטסומוטו  (Rie Matsumoto) הנספחת המסחרית וכן גב' רותם ירקוני – יועצת כלכלית.

 

על הקשר המשולש: KLA-Tencor / TOSHIBA והפקולטה להנדסה

כאמור KLA-Tencor חברה בארגון עמיתי התעשיה של הפקולטה להנדסה מזה כ- 4 שנים. במסגרת הקשר מתקיימים שיתופי פעולה מפרים ומגוונים כגון מחקר, מלגות לסטודנטים, הרצאות ועוד. גולת הכותרת של שיתוף הפעולה עם הפקולטה הינה החסות שהחברה נותנת לתוכנית המצוינים של בית הספר להנדסת חשמל.  TOSHIBA הינה מהחשובים בלקוחותיה של KLA-Tencor  ,ובין החברות ומתקיימים שיתופי פעולה חשובים וארוכים. זו גם הסיבה  ש- KLA-Tencorארגנה את ביקור TOSHIBA בישראל, מציאת סטודנטים מתאימים מהפקולטה להנדסה באוניברסיטת תל אביב שיצטרפו לצוות החדשנות הטכנולוגית שלהם ביפן.

 

על הביקור

הביקור התחיל בסקירה כללית על הפקולטה להנדסה שניתנה על ידי פרופ' דוד מנדלוביץ, מארגון עמיתי התעשייה של הפקולטה וסקירה על בית הספר להנדסת חשמל על ידי ראש בית הספר פרופ' מרק שטייף, ותיאורים של שני מחקרים מרתקים ע"י חוקרים בכירים של הפקולטה - פרופ' קובי שויער  וד"ר אלון באב"ד. משם יצאה המשלחת לסיור בקמפוס ודגש מיוחד ניתן לסיור במעבדה למערכות בקרה ומערכות אוטונומיות המנוהלת ע"י יוני מנדל. לסיום נפגשו הסטודנטים עם נציגי TOSHIBA וקיבלו סקירה מלאה לגבי המשרה שמציעה החברה בצוות החדשנות שלה ביפן ברילוקיישן. מהמשוב שקיבלנו עולה כי נציגי KLA-Tencor ו-TOSHIBA התרשמו מאוד מהחוקרים שלנו, מהסיור במעבדה ובעיקר ממהנדסי העתיד שלנו!

EE Seminar: Minimal Controllability and Observability of Conjunctive Boolean Networks

29 בנובמבר 2017, 15:00 
חדר 011, בניין כיתות-חשמל  

Speaker: Eyal Weiss,

M.Sc. student under the supervision of Prof. Michael Margaliot

 

Wednesday, November 29th, 2017 at 15:00

Room 011, Kitot Bldg., Faculty of Engineering

 

 

Minimal Controllability and Observability of Conjunctive Boolean  Networks

 

Abstract

 

Boolean networks have been found to be a powerful tool in modeling the behavior of various biological systems, and in particular, gene regulating networks. In this study, we have considered a special class of these networks, termed Conjunctive Boolean Networks (CBNs).

Controllability and observability are two fundamental properties of systems, from a control-theoretic perspective. Here we address the minimal controllability and observability problems for CBNs, that is, we attempt to find a minimal set of state variables to affect with an input (output), such that the resulting system is controllable (observable). To that end, we use a graph-theoretic approach, and derive the new concept of controlled (observed) paths.

In my talk, I will present necessary and sufficient conditions for the above mentioned properties, review complexity results, and give the general structure of the algorithms derived for solving the problems. As time permits, I will also present simulation results and discuss their implications.

פרופ' גיא אבן

פרופ' גיא אבן

 

פרופ' שמואל [שי] אבידן

פרופ' שמואל אבידן

 

עמודים

אוניברסיטת תל אביב עושה כל מאמץ לכבד זכויות יוצרים. אם בבעלותך זכויות יוצרים בתכנים שנמצאים פה ו/או השימוש שנעשה בתכנים אלה לדעתך מפר זכויות
שנעשה בתכנים אלה לדעתך מפר זכויות נא לפנות בהקדם לכתובת שכאן >>